65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5584 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 275 aa  567  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  86.03 
 
 		 278 aa  490  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  83.46 
 
 		 278 aa  483  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  83.46 
 
 		 278 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  77.01 
 
 		 277 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  63.92 
 
 		 253 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  52.33 
 
 		 263 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  52.24 
 
 		 346 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  52.34 
 
 		 279 aa  298  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  51.17 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  51.49 
 
 		 271 aa  294  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  50.79 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  49.43 
 
 		 257 aa  268  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  46.74 
 
 		 261 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  47.13 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  45.98 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  45.95 
 
 		 263 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  45.95 
 
 		 263 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  44.66 
 
 		 266 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  42.69 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  40.24 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  40.44 
 
 		 257 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  40.41 
 
 		 247 aa  189  5e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  36.4 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  37.65 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  37.9 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  35.89 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  35.89 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  37.76 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  39.92 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 259 aa  170  3e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  35.74 
 
 		 244 aa  162  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  36.86 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  38.1 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  25.3 
 
 		 508 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  24.27 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  22.47 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  22.33 
 
 		 387 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  24.62 
 
 		 403 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 371 aa  52.4  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  26.01 
 
 		 397 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  25.65 
 
 		 508 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  26.37 
 
 		 393 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  24.31 
 
 		 406 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 		 374 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.12 
 
 		 397 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  22.12 
 
 		 400 aa  46.2  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  22.94 
 
 		 406 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.66 
 
 		 585 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  22.28 
 
 		 387 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 		 399 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 		 391 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  20.3 
 
 		 402 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  20.87 
 
 		 402 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 396 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 		 351 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  22.07 
 
 		 884 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 		 414 aa  42.7  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 		 576 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  20.1 
 
 		 402 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>