66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2498 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
255 aa  526  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  57.2 
 
 
259 aa  311  7.999999999999999e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  54.66 
 
 
253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  54.66 
 
 
253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  51.76 
 
 
257 aa  280  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  53.63 
 
 
263 aa  280  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  49.61 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  51 
 
 
254 aa  258  8e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  44.4 
 
 
253 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  43.37 
 
 
254 aa  201  9e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  39.75 
 
 
246 aa  200  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  41.11 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
257 aa  194  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  42.79 
 
 
346 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  40.32 
 
 
261 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  38.87 
 
 
279 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  39.27 
 
 
271 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  39.53 
 
 
261 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  38 
 
 
263 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  39.11 
 
 
247 aa  186  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  38.49 
 
 
244 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  38.04 
 
 
266 aa  185  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  37.66 
 
 
246 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  37.25 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  37.9 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  41.07 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
277 aa  181  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  37.4 
 
 
278 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  37.4 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  37.4 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  37.24 
 
 
244 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  36.8 
 
 
263 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  36.8 
 
 
263 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  39.01 
 
 
253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  45.45 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 
370 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  30.99 
 
 
374 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 
371 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  27.73 
 
 
508 aa  87  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
344 aa  82  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  25.35 
 
 
393 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0533  metallo-beta-lactamase family protein  54 
 
 
52 aa  62.4  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000264713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
400 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  23.76 
 
 
397 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 
387 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 
387 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 
392 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  22.86 
 
 
403 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.49 
 
 
394 aa  50.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 
388 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  28.05 
 
 
404 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  23.3 
 
 
387 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.38 
 
 
575 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 
393 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  26.23 
 
 
393 aa  45.8  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1078  metallo-beta-lactamase family protein  25.52 
 
 
408 aa  45.4  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
399 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  22.48 
 
 
378 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  22.5 
 
 
884 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0174  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.53 
 
 
398 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 
402 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  20.72 
 
 
573 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2889  beta-lactamase domain-containing protein  24.72 
 
 
410 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.726482  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  24.02 
 
 
395 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  23.32 
 
 
571 aa  42  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>