123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1868 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  526  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  60.96 
 
 		 253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  60.96 
 
 		 253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  60 
 
 		 263 aa  325  5e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  58.66 
 
 		 259 aa  324  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  56.63 
 
 		 257 aa  289  4e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  57.66 
 
 		 259 aa  288  6e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  51 
 
 		 255 aa  258  7e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  47.04 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  41.25 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  44.22 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  41.77 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  40.56 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  40.48 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  40 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  38.43 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  38.43 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  39.38 
 
 		 266 aa  188  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  38.43 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  38.93 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  37.85 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  40.52 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  37.9 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  37.25 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  36.95 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  36.29 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  36.29 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  36.59 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  46.15 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  31.58 
 
 		 508 aa  106  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 370 aa  92.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 374 aa  89  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  28.7 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  28.57 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  27.09 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  27.72 
 
 		 406 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  24.88 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  24.88 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  26.87 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  26.73 
 
 		 884 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  25.94 
 
 		 417 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0172  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.51 
 
 		 398 aa  57  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0174  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.7 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  26.92 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  26.85 
 
 		 571 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  24.2 
 
 		 404 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.45 
 
 		 576 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  25.11 
 
 		 404 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 391 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 		 407 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.38 
 
 		 576 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  21.6 
 
 		 402 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  24.55 
 
 		 878 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 		 407 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  24.55 
 
 		 878 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 		 387 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 		 387 aa  52.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 425 aa  52.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  23.81 
 
 		 576 aa  52.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  27.75 
 
 		 579 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  26.37 
 
 		 407 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  26.61 
 
 		 575 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  25.41 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  25.11 
 
 		 393 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  24.37 
 
 		 395 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 		 407 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.57 
 
 		 423 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 		 396 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  23.65 
 
 		 407 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.54 
 
 		 575 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  28.57 
 
 		 572 aa  49.7  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  27.8 
 
 		 403 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 		 407 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.64 
 
 		 575 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.64 
 
 		 575 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 		 394 aa  48.9  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 		 396 aa  48.9  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  22.77 
 
 		 402 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 		 402 aa  48.9  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 395 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3660  beta-lactamase domain-containing protein  23.83 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 		 387 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  24.04 
 
 		 395 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  24.63 
 
 		 582 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  23.53 
 
 		 407 aa  47  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  22.87 
 
 		 431 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 		 573 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>