59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1128 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 261 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  85.06 
 
 		 261 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  85.44 
 
 		 261 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  61.07 
 
 		 266 aa  355  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  63.57 
 
 		 257 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  53.64 
 
 		 257 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  52.87 
 
 		 263 aa  284  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  52.31 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  50.19 
 
 		 257 aa  278  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  49.25 
 
 		 278 aa  277  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  50.77 
 
 		 279 aa  274  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  48.87 
 
 		 278 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  48.87 
 
 		 278 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  51.92 
 
 		 271 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  49.03 
 
 		 277 aa  265  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  46.74 
 
 		 275 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  48.63 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  46.92 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  44.31 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  41.96 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  41.96 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  40.24 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  40.08 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  42.61 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  39.53 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  39.2 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  39.76 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  39.73 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  37.4 
 
 		 243 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  35.63 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  44.44 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  24.35 
 
 		 508 aa  72.4  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 374 aa  65.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  25.36 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  23.28 
 
 		 406 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  25 
 
 		 884 aa  52  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 		 387 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 		 387 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 		 387 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  22.84 
 
 		 406 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.3 
 
 		 585 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  23.39 
 
 		 508 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2887  Beta-lactamase-like protein  27.81 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 		 400 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 		 576 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  23.61 
 
 		 414 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  23.68 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  25.84 
 
 		 397 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 		 387 aa  42.7  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 352 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>