101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0910 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
253 aa  525  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
253 aa  525  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  67.33 
 
 
259 aa  383  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  67.59 
 
 
263 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  60.96 
 
 
254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  59.51 
 
 
257 aa  324  8.000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  56.35 
 
 
259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  54.66 
 
 
255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  44.49 
 
 
246 aa  228  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  44.05 
 
 
254 aa  221  8e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  46.67 
 
 
247 aa  218  6e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  42.62 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  44.76 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  41.22 
 
 
244 aa  208  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  40.08 
 
 
244 aa  205  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  41.57 
 
 
261 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  41.96 
 
 
261 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  41.18 
 
 
261 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  43.04 
 
 
346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  39.92 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  42.24 
 
 
263 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 
271 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  38.02 
 
 
246 aa  198  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  39.02 
 
 
279 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  39.76 
 
 
266 aa  195  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  41.81 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 
263 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  38.89 
 
 
263 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  36.69 
 
 
278 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 
277 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  37.8 
 
 
257 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  37.4 
 
 
253 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  35.89 
 
 
275 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  36.69 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  36.69 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  52.63 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  30.73 
 
 
508 aa  105  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
370 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 
374 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 
371 aa  85.5  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 
344 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  25.93 
 
 
418 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  26.87 
 
 
387 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 
414 aa  61.2  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 
400 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 
402 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 
394 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  26.01 
 
 
387 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 
402 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  24.87 
 
 
406 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 
387 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 
395 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  24.87 
 
 
406 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  22.17 
 
 
387 aa  53.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  23.56 
 
 
884 aa  53.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  23.83 
 
 
378 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 
395 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.19 
 
 
404 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  24.77 
 
 
571 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 
397 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0503  beta-lactamase domain-containing protein  22.92 
 
 
401 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0527629  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 
392 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  26.36 
 
 
403 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.01 
 
 
401 aa  49.7  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  23.04 
 
 
402 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  23.56 
 
 
417 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 
391 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.17 
 
 
573 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  23.87 
 
 
404 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  23.04 
 
 
393 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  25 
 
 
405 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.91 
 
 
397 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 
405 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  25.56 
 
 
404 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.18 
 
 
573 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  23.61 
 
 
396 aa  46.6  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  22.75 
 
 
400 aa  46.2  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  24.05 
 
 
499 aa  46.2  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.35 
 
 
396 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 
396 aa  45.4  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0533  metallo-beta-lactamase family protein  39.22 
 
 
52 aa  45.4  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000264713  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  25.24 
 
 
572 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  25.73 
 
 
402 aa  45.4  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  30.33 
 
 
213 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  23.36 
 
 
401 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  22.17 
 
 
407 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.15 
 
 
574 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.91 
 
 
576 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  24.17 
 
 
500 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  22.6 
 
 
396 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0172  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.59 
 
 
398 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  21.46 
 
 
396 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.91 
 
 
576 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5452  beta-lactamase domain-containing protein  21.2 
 
 
243 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.89 
 
 
396 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 
407 aa  42.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  20 
 
 
508 aa  42.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.3 
 
 
575 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.3 
 
 
575 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  22.17 
 
 
407 aa  42  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>