148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0356 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  532  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  67.33 
 
 		 253 aa  383  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  67.33 
 
 		 253 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  63.41 
 
 		 263 aa  358  4e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  58.66 
 
 		 254 aa  324  1e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  59.76 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  57.66 
 
 		 257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  49.61 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  45.97 
 
 		 247 aa  225  6e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  42.08 
 
 		 246 aa  224  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  46.18 
 
 		 254 aa  218  7.999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  43.82 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  39.92 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  39 
 
 		 244 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  38.56 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  38.8 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  35.43 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  36.08 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  37.7 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  36.4 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  39.29 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  39.29 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  36.33 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  38.49 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  35.94 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  34.94 
 
 		 279 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  36.05 
 
 		 266 aa  178  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  35.63 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  35.22 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  53.51 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  31.58 
 
 		 508 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 		 370 aa  89.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 		 374 aa  85.9  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 344 aa  82  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 371 aa  75.9  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 387 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  28.18 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  27.5 
 
 		 417 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 		 402 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  29.26 
 
 		 406 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  26.74 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  29.86 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  29.26 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  27.75 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  25.31 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  26.76 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0503  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0527629  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  24.63 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  25.23 
 
 		 404 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  23.98 
 
 		 582 aa  55.8  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.48 
 
 		 397 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  25.57 
 
 		 396 aa  55.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 400 aa  55.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  24.07 
 
 		 571 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 		 405 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  22.57 
 
 		 884 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 		 397 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.05 
 
 		 575 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.42 
 
 		 574 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.05 
 
 		 575 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.37 
 
 		 396 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0448  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0461  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.304933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0472  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249938  normal  0.535874 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 387 aa  52.8  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  30.15 
 
 		 638 aa  52.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 		 407 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  24.14 
 
 		 579 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 		 576 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  23.85 
 
 		 396 aa  52  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 		 401 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  26.42 
 
 		 395 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  23.65 
 
 		 572 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 		 576 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  24.66 
 
 		 393 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  24.86 
 
 		 395 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  24.29 
 
 		 399 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  24.29 
 
 		 399 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 404 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3660  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 393 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.73 
 
 		 575 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.42 
 
 		 573 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.53 
 
 		 573 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>