90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2738 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  63.57 
 
 		 261 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  63.04 
 
 		 261 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  62.26 
 
 		 261 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  57.59 
 
 		 266 aa  327  9e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  50.97 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  50.97 
 
 		 257 aa  281  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  52.31 
 
 		 279 aa  278  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  51.55 
 
 		 278 aa  278  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  52.85 
 
 		 277 aa  275  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  50.38 
 
 		 346 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  50.38 
 
 		 271 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  47.49 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  49.43 
 
 		 275 aa  268  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  51.37 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  51.37 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  44.83 
 
 		 263 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  44.83 
 
 		 263 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  44.49 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  45.31 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  45.95 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  41.46 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  42.69 
 
 		 259 aa  204  8e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  38.21 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  39.92 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  39.92 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 255 aa  194  9e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  38.8 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  38.65 
 
 		 263 aa  191  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  39.43 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  38.4 
 
 		 244 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  39.68 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 		 244 aa  162  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  43.17 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  23.81 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  25.11 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 374 aa  68.9  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  24.77 
 
 		 406 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 		 371 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  23.47 
 
 		 884 aa  55.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 		 395 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.85 
 
 		 585 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  23.53 
 
 		 406 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  23.79 
 
 		 392 aa  53.1  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 		 395 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  24.69 
 
 		 399 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  24.89 
 
 		 393 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 396 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  23.42 
 
 		 387 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  23.83 
 
 		 400 aa  48.9  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  36 
 
 		 575 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  28.23 
 
 		 638 aa  48.9  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  22.47 
 
 		 378 aa  48.5  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  24.8 
 
 		 387 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  23.79 
 
 		 387 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0834  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.25 
 
 		 573 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.293861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  21.93 
 
 		 396 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  29.11 
 
 		 403 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0805  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.68 
 
 		 573 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 		 576 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  22.5 
 
 		 402 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 		 388 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  28.48 
 
 		 569 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  20.78 
 
 		 396 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  22.02 
 
 		 396 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  22.45 
 
 		 399 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  22.45 
 
 		 399 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 		 387 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  22.27 
 
 		 384 aa  43.5  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.26 
 
 		 576 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  23.11 
 
 		 418 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  23.65 
 
 		 395 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4139  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  24.07 
 
 		 601 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  25.46 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  22.32 
 
 		 417 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 		 571 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  22.69 
 
 		 407 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  26.58 
 
 		 571 aa  42.4  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0504  beta-lactamase domain protein  22.71 
 
 		 405 aa  42.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  25.91 
 
 		 582 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  34.21 
 
 		 570 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 571 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  20.56 
 
 		 425 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.26 
 
 		 576 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>