65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0715 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  89.21 
 
 		 278 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  83.46 
 
 		 275 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  79.34 
 
 		 277 aa  467  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  62.6 
 
 		 253 aa  329  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  52.53 
 
 		 263 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  53.36 
 
 		 279 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  52.17 
 
 		 257 aa  301  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  54.15 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  53.75 
 
 		 271 aa  294  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  52.36 
 
 		 257 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  48.87 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  49.43 
 
 		 261 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  51.37 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  48.3 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  46.1 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  46.88 
 
 		 263 aa  251  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  46.88 
 
 		 263 aa  251  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  43.25 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  42.29 
 
 		 253 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  41.78 
 
 		 257 aa  202  7e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  36.69 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  36.69 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  37.4 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  37.65 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  36.29 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  39.5 
 
 		 244 aa  175  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  36.51 
 
 		 246 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  35.59 
 
 		 243 aa  159  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  40 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  26.55 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 		 370 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  21.27 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  27.07 
 
 		 403 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 		 396 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  27.73 
 
 		 393 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  25.41 
 
 		 406 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.03 
 
 		 585 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 371 aa  46.6  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  21.3 
 
 		 402 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  25.32 
 
 		 508 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 		 576 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  21.7 
 
 		 400 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 		 351 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 		 399 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.35 
 
 		 574 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  24.46 
 
 		 414 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 		 391 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  24.32 
 
 		 406 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  22.6 
 
 		 884 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 374 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00451  flavoprotein  21.34 
 
 		 600 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0043  flavoprotein  21.57 
 
 		 593 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  24.09 
 
 		 395 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>