64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4918 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  98.08 
 
 		 261 aa  534  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  85.44 
 
 		 261 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  60.69 
 
 		 266 aa  348  7e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  63.04 
 
 		 257 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  53.46 
 
 		 257 aa  294  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  50.19 
 
 		 257 aa  288  8e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  52.11 
 
 		 346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  51.72 
 
 		 271 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  51.15 
 
 		 263 aa  278  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  51.15 
 
 		 263 aa  278  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  50.57 
 
 		 279 aa  278  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  50.57 
 
 		 263 aa  275  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  49.43 
 
 		 278 aa  271  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  49.43 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  49.43 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  50.39 
 
 		 277 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  47.13 
 
 		 275 aa  261  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  49.21 
 
 		 254 aa  261  6.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  46.09 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  47.49 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  43.03 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  43.25 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  41.18 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  40.71 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  41.11 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  41.5 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  38 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  35.94 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  38.96 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  36.61 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  36.44 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 		 246 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  42.4 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  27.47 
 
 		 508 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 370 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  22.94 
 
 		 387 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 		 387 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  24.65 
 
 		 884 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  23.71 
 
 		 406 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 		 585 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  23.58 
 
 		 400 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  26.74 
 
 		 399 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 		 399 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 		 392 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  23.28 
 
 		 406 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  28.23 
 
 		 397 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 576 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  27.54 
 
 		 878 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  27.33 
 
 		 878 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  21.6 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  23.96 
 
 		 508 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  22.38 
 
 		 399 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  21.72 
 
 		 402 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  23.12 
 
 		 397 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>