101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1458 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  100 
 
 		 244 aa  507  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  78.19 
 
 		 243 aa  421  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  73.75 
 
 		 244 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  73.75 
 
 		 246 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  49.58 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  43.57 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  41.22 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  41.22 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  39.84 
 
 		 263 aa  205  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  39 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  39.2 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  38.8 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  40.98 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  37.96 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  38 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  40.57 
 
 		 271 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  39.51 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  40.16 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  37.24 
 
 		 255 aa  177  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  39.75 
 
 		 346 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  38.78 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  40.51 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  39.5 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  39.5 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  39.92 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  38.4 
 
 		 257 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  39.5 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  37.1 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  37.07 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  37.56 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  37.1 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  47.97 
 
 		 291 aa  125  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  25.23 
 
 		 508 aa  94.7  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  25.13 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  25.13 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 		 395 aa  62  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  26.51 
 
 		 418 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  24.23 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  23.26 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  24.23 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  23.44 
 
 		 884 aa  59.3  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  26.7 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  25.12 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  23.74 
 
 		 402 aa  55.5  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 		 402 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  23.71 
 
 		 396 aa  55.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  22.43 
 
 		 414 aa  55.1  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  25.26 
 
 		 387 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  22 
 
 		 395 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  23.23 
 
 		 878 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  22.73 
 
 		 878 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  21.3 
 
 		 406 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  24 
 
 		 402 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 407 aa  49.7  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  20.66 
 
 		 402 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1078  metallo-beta-lactamase family protein  22.9 
 
 		 408 aa  49.7  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  22.97 
 
 		 394 aa  49.3  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  23.65 
 
 		 396 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  21.3 
 
 		 406 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  23.36 
 
 		 396 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  20.93 
 
 		 400 aa  48.9  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  22.64 
 
 		 396 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  24.12 
 
 		 378 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 		 387 aa  45.8  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  22.84 
 
 		 425 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  21.84 
 
 		 396 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  21.53 
 
 		 392 aa  45.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06350  uncharacterized flavoprotein  23.53 
 
 		 420 aa  45.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.882044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  23.47 
 
 		 388 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  21.54 
 
 		 395 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1524  hypothetical protein  22.58 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  22.22 
 
 		 423 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  22.6 
 
 		 571 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 576 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  19.91 
 
 		 394 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  23.96 
 
 		 579 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  23 
 
 		 384 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  24.04 
 
 		 399 aa  43.5  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  20.41 
 
 		 407 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  19.52 
 
 		 393 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0504  beta-lactamase domain protein  22.38 
 
 		 405 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  25.63 
 
 		 403 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  22.09 
 
 		 398 aa  43.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  22.92 
 
 		 572 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2889  beta-lactamase domain-containing protein  22.49 
 
 		 410 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.726482  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 		 286 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  19.44 
 
 		 396 aa  42  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>