49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2256 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 263 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 263 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  56.2 
 
 		 257 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  52.87 
 
 		 271 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  52.87 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  52.67 
 
 		 261 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  52.45 
 
 		 346 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  53.05 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  52.11 
 
 		 263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  50.76 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  47.89 
 
 		 257 aa  268  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  46.88 
 
 		 278 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  46.36 
 
 		 257 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  46.33 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  47.66 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  47.66 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  46.77 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  44.62 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  47.31 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  47.29 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  45.7 
 
 		 253 aa  228  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  42.17 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  38.15 
 
 		 247 aa  188  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  40.08 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  38.74 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  37.5 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  36.8 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  38.31 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  38.31 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  37.1 
 
 		 243 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  40.77 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  23.72 
 
 		 508 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  26.38 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  22.51 
 
 		 392 aa  50.4  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  21.07 
 
 		 406 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  23.19 
 
 		 884 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  23.36 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  22.13 
 
 		 402 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  20.66 
 
 		 406 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  23.42 
 
 		 508 aa  42.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  22.98 
 
 		 393 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>