94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1332 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  56.45 
 
 
253 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  49.61 
 
 
261 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  49.21 
 
 
261 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  48.63 
 
 
261 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  45.77 
 
 
263 aa  240  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  45.77 
 
 
263 aa  240  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  44.09 
 
 
257 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  44.49 
 
 
257 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  46.03 
 
 
257 aa  235  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  44.75 
 
 
266 aa  232  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  43.5 
 
 
247 aa  228  8e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  43.25 
 
 
263 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  44.05 
 
 
253 aa  221  8e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  44.05 
 
 
253 aa  221  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  47.79 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  43.8 
 
 
277 aa  218  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  46.18 
 
 
259 aa  218  7.999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  41.27 
 
 
278 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  42.29 
 
 
271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  44.22 
 
 
257 aa  216  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  41.41 
 
 
346 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  43.25 
 
 
278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  43.25 
 
 
278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  44.22 
 
 
254 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  40.71 
 
 
279 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  42.4 
 
 
263 aa  205  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  40.24 
 
 
275 aa  201  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  43.37 
 
 
255 aa  201  9e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  41.37 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  39.09 
 
 
246 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  40.91 
 
 
244 aa  175  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  41.44 
 
 
246 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  40.36 
 
 
243 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  40.18 
 
 
244 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  48.84 
 
 
291 aa  131  9e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  27.43 
 
 
508 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 
374 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 
344 aa  86.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  25.11 
 
 
393 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 
402 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
397 aa  62  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 
392 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  25.59 
 
 
388 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  24.02 
 
 
387 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  23.89 
 
 
878 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 
387 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  23.89 
 
 
878 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 
387 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  26.38 
 
 
387 aa  53.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.55 
 
 
576 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.55 
 
 
576 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  23.44 
 
 
402 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  21.56 
 
 
400 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  22.86 
 
 
508 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  22.22 
 
 
402 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  23.15 
 
 
418 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  26.11 
 
 
378 aa  49.3  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  23.87 
 
 
399 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  23.87 
 
 
399 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  25.76 
 
 
576 aa  48.5  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  25.52 
 
 
406 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  20.5 
 
 
884 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 
393 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 
396 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 
395 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  22.17 
 
 
396 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  23.45 
 
 
571 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  25 
 
 
395 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 
391 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 
393 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  20.78 
 
 
407 aa  46.2  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  26.98 
 
 
406 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
392 aa  45.4  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  26.42 
 
 
572 aa  45.4  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  24.29 
 
 
417 aa  45.4  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  24.64 
 
 
579 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 
394 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 
407 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1078  metallo-beta-lactamase family protein  22.27 
 
 
408 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  23.98 
 
 
407 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  21.1 
 
 
414 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 
399 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  24.3 
 
 
209 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5452  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  22.16 
 
 
407 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 
387 aa  42.7  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  23.62 
 
 
425 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  22.68 
 
 
407 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0594  hypothetical protein  23.98 
 
 
240 aa  42.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2887  Beta-lactamase-like protein  22.84 
 
 
248 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  22.55 
 
 
403 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>