159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0941 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
247 aa  507  1e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  43.5 
 
 
254 aa  228  8e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  45.97 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  46.15 
 
 
263 aa  224  9e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  46.67 
 
 
253 aa  218  6e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  46.67 
 
 
253 aa  218  6e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  43.87 
 
 
261 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  43.03 
 
 
261 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  45.97 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  37.25 
 
 
257 aa  204  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  41.77 
 
 
254 aa  202  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  38.62 
 
 
257 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 
257 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  40.24 
 
 
261 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  38.62 
 
 
271 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  36.69 
 
 
263 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
277 aa  194  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
278 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  41.7 
 
 
253 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 
346 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  38.25 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  40.41 
 
 
275 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
278 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
278 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 
255 aa  186  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  36.18 
 
 
279 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  37.3 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  37.96 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  37.3 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  35.12 
 
 
246 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 
243 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  40.71 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  40.18 
 
 
244 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  39.46 
 
 
246 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  37.22 
 
 
253 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  48 
 
 
291 aa  132  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  27.35 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  28.05 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  28.05 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  28.84 
 
 
508 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  28.1 
 
 
878 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  28.1 
 
 
878 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 
397 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  25.37 
 
 
884 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  24.55 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  25.11 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  29.76 
 
 
576 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  26.76 
 
 
407 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 
371 aa  68.6  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 
395 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  28.37 
 
 
575 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 
407 aa  65.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  25.23 
 
 
407 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 
395 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 
407 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 
407 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.86 
 
 
576 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06350  uncharacterized flavoprotein  27.5 
 
 
420 aa  63.5  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.882044  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  26.58 
 
 
571 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.86 
 
 
576 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  21.61 
 
 
414 aa  62  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  28.74 
 
 
406 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 
400 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
398 aa  60.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  27.11 
 
 
406 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 
399 aa  59.3  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  25.45 
 
 
393 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 
395 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.17 
 
 
404 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 
387 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  23.98 
 
 
402 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 
402 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  24.15 
 
 
387 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  23.3 
 
 
423 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  22.84 
 
 
396 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  23.83 
 
 
394 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  22.84 
 
 
401 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 
384 aa  55.8  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.73 
 
 
575 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.73 
 
 
575 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0504  beta-lactamase domain protein  22.94 
 
 
405 aa  54.7  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  25.68 
 
 
574 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27 
 
 
396 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  23.77 
 
 
395 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.96 
 
 
574 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  23.64 
 
 
402 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  23.14 
 
 
391 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  22.79 
 
 
387 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  24.65 
 
 
393 aa  53.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2027  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.26 
 
 
404 aa  53.1  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.719198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  21.62 
 
 
402 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>