70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4836 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
277 aa  570  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  79.34 
 
 
278 aa  467  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  79.34 
 
 
278 aa  467  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  79.34 
 
 
278 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  77.01 
 
 
275 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  53.73 
 
 
346 aa  319  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  54.47 
 
 
279 aa  315  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  52.51 
 
 
263 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  58.43 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  52.61 
 
 
271 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  52.57 
 
 
257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  51.17 
 
 
257 aa  295  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  52.85 
 
 
257 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  49.03 
 
 
261 aa  265  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  50.39 
 
 
261 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  49.22 
 
 
261 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  47.67 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  44.62 
 
 
263 aa  244  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  44.62 
 
 
263 aa  244  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  43.8 
 
 
254 aa  218  7.999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  42.29 
 
 
253 aa  205  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
247 aa  194  9e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  40.43 
 
 
257 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 
253 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 
253 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  38.49 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  39.27 
 
 
259 aa  183  3e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  40.52 
 
 
254 aa  180  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  41.13 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  37.3 
 
 
246 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  39.5 
 
 
244 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 
246 aa  162  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  36.17 
 
 
244 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  36.02 
 
 
243 aa  158  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  38.4 
 
 
291 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  26.38 
 
 
508 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  23.76 
 
 
392 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 
397 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
344 aa  62.4  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  23.88 
 
 
387 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  22.89 
 
 
387 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  23.85 
 
 
406 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  21.89 
 
 
387 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  24.31 
 
 
406 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  27.82 
 
 
403 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 
391 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 
400 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  26.87 
 
 
508 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  28.57 
 
 
393 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  21.03 
 
 
402 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  21.33 
 
 
884 aa  48.9  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 
399 aa  48.9  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  24.64 
 
 
387 aa  48.9  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 
371 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  19.69 
 
 
402 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
351 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  22.01 
 
 
387 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 
396 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  20.18 
 
 
402 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 
352 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  21.23 
 
 
378 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.21 
 
 
396 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  21.46 
 
 
418 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 
374 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  28.43 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  21.51 
 
 
401 aa  43.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  20.4 
 
 
401 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 
393 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>