52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1152 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1152  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 257 aa  538  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2212  hypothetical protein  57.81 
 
 		 279 aa  322  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2410  beta-lactamase domain protein  56.25 
 
 		 346 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2016  beta-lactamase domain protein  55.86 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.412379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0043  Beta-lactamase-like  54.69 
 
 		 263 aa  311  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0019  beta-lactamase-like protein  53.57 
 
 		 257 aa  308  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5584  beta-lactamase domain-containing protein  51.17 
 
 		 275 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4836  beta-lactamase domain-containing protein  51.17 
 
 		 277 aa  295  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0991  beta-lactamase domain-containing protein  51.18 
 
 		 278 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0695  beta-lactamase domain protein  52.36 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0715  beta-lactamase domain-containing protein  52.36 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.349181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56540  hypothetical protein  50.19 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4918  hypothetical protein  50.19 
 
 		 261 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2738  beta-lactamase domain protein  50.97 
 
 		 257 aa  281  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.304936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1128  beta-lactamase domain-containing protein  50.19 
 
 		 261 aa  278  8e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1283  beta-lactamase domain-containing protein  51.17 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000047241 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2153  beta-lactamase domain-containing protein  50.57 
 
 		 266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2256  metallo-beta-lactamase family protein  46.74 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1903  beta-lactamase domain protein  46.74 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1332  beta-lactamase domain protein  46.03 
 
 		 254 aa  235  4e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6137  hypothetical protein  46.46 
 
 		 253 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.858246  normal  0.0280833 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  38.62 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1868  beta-lactamase domain-containing protein  40.56 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000140017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0700  beta-lactamase domain-containing protein  39.11 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0391  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0910  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0932  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2498  metallo-beta-lactamase family protein  41.07 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000115664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0995  Beta-lactamase-like  34.84 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1458  uncharacterized flavoprotein  37.56 
 
 		 244 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408198  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1892  beta-lactamase domain-containing protein  34.82 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1741  beta-lactamase domain-containing protein  36.99 
 
 		 243 aa  152  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  34.82 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0517  hypothetical protein  44.8 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0063692  hitchhiker  0.000555484 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  27.23 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1716  beta-lactamase domain protein  23.14 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  24.34 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0266  beta-lactamase domain protein  23.33 
 
 		 374 aa  53.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3006  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 		 344 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  25.89 
 
 		 406 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  24.41 
 
 		 508 aa  52  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  25.7 
 
 		 884 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3524  beta-lactamase domain protein  24.69 
 
 		 370 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  23.71 
 
 		 400 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  24.49 
 
 		 406 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  24.31 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 		 387 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  21.33 
 
 		 402 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  23.27 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>