More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2521 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2521  Mrp protein  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2835  ATPase  98.94 
 
 		 284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  45.35 
 
 		 281 aa  245  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1211  nucleotide-binding protein  45.32 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000175962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1654  nucleotide-binding protein  45.15 
 
 		 279 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0329038  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  45.02 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  43.66 
 
 		 302 aa  234  9e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2286  chromosome partitioning ATPase  47.03 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3017  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  44.73 
 
 		 439 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000106278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0091  hypothetical protein  42.96 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0264  chromosome partitioning ATPase  44.4 
 
 		 328 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0104  hypothetical protein  44.05 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000677137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1985  nucleotide-binding protein  42.7 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0660  nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522627  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2518  nucleotide-binding protein  44.94 
 
 		 276 aa  222  4.9999999999999996e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00750762  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2227  ATP-binding protein  44.64 
 
 		 280 aa  216  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.14194 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  46.35 
 
 		 419 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_114  hydrogenase 1 maturation protease-like protein  45.11 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0943  ATP-binding protein  48.33 
 
 		 282 aa  208  9e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  45.26 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04680  chromosome partitioning ATPase  44.36 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  40.66 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08340  chromosome partitioning ATPase  47.04 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.16254 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  46.96 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  40.75 
 
 		 395 aa  199  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  44.1 
 
 		 376 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  43.72 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  42.86 
 
 		 361 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  42.42 
 
 		 364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  44.21 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  41.8 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  41.34 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  44.59 
 
 		 363 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  43.07 
 
 		 382 aa  195  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  39.06 
 
 		 363 aa  194  9e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.35 
 
 		 348 aa  194  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2115  ParA family protein  44.16 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1525  ATP-binding protein  47.01 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.486676  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  44.98 
 
 		 365 aa  193  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1127  hypothetical protein  41.55 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  38.87 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4314  hypothetical protein  43.6 
 
 		 364 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  43.23 
 
 		 360 aa  192  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.72 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  42.23 
 
 		 364 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.55 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1343  Mrp protein  44.98 
 
 		 347 aa  192  5e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.654252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1978  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.45 
 
 		 371 aa  192  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000194849  hitchhiker  0.00590431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1098  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.6 
 
 		 364 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  43.67 
 
 		 373 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1138  hypothetical protein  43.6 
 
 		 364 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192644  normal  0.84977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  41.77 
 
 		 375 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  38.55 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  40.93 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  42.79 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  44.35 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.87 
 
 		 372 aa  190  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  43.89 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  43.23 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  41.63 
 
 		 382 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  40.53 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0663  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  42.25 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.95 
 
 		 408 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  45.49 
 
 		 376 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  42.17 
 
 		 374 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  44.18 
 
 		 376 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  40.85 
 
 		 370 aa  189  4e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  44.16 
 
 		 362 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  41.56 
 
 		 374 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2838  putative mrp protein  43.1 
 
 		 391 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0284462  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1547  ParA family protein  43.91 
 
 		 356 aa  188  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97129  hitchhiker  0.000107443 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0394  polysaccharide export protein  40.98 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  41.3 
 
 		 378 aa  188  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  45.02 
 
 		 363 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  44.25 
 
 		 387 aa  188  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  44.77 
 
 		 363 aa  188  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.78 
 
 		 371 aa  188  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.240141 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  41.3 
 
 		 361 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  43.48 
 
 		 363 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  40.4 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  43.16 
 
 		 367 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  41.42 
 
 		 415 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1426  ATP-binding protein  42.49 
 
 		 408 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.904021  normal  0.20108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4506  ParA family protein  45.89 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372356 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.44 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  42.74 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  42.34 
 
 		 364 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  43.16 
 
 		 389 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  44.16 
 
 		 371 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1656  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.77 
 
 		 371 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1731  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.77 
 
 		 371 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1761  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.77 
 
 		 371 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.16 
 
 		 371 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.16 
 
 		 371 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  43.81 
 
 		 394 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.16 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  41.56 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.56 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.35 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.56 
 
 		 362 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>