More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2671 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2671  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 358 aa  719    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0288332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2757  peptide chain release factor 1  82.67 
 
 		 364 aa  528  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  54.19 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  50.58 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  51.54 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  51.46 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  51.17 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  51.17 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  52.34 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 355 aa  361  9e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  51.38 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 359 aa  358  9e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  49.3 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1891  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 352 aa  355  5.999999999999999e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.000000000024235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 359 aa  355  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 358 aa  352  5e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  50.44 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  52.34 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 354 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  50.44 
 
 		 356 aa  349  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 		 356 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  49.27 
 
 		 356 aa  348  7e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  47.59 
 
 		 355 aa  345  6e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 355 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  47.63 
 
 		 366 aa  342  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  46.74 
 
 		 355 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  46.74 
 
 		 355 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 		 357 aa  341  9e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  46.46 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  46.46 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  46.46 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  46.46 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  46.46 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  46.46 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  46.61 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  47.35 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 		 367 aa  339  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 356 aa  339  5e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  47.03 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  46.18 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  46.18 
 
 		 358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08900  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 357 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000087001  normal  0.899711 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  46.89 
 
 		 357 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  51.33 
 
 		 358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  46.69 
 
 		 368 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  45.68 
 
 		 358 aa  332  6e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 360 aa  332  7.000000000000001e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  48.48 
 
 		 364 aa  332  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 357 aa  329  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  48.61 
 
 		 364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  46.5 
 
 		 358 aa  329  6e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 361 aa  328  9e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  46.78 
 
 		 358 aa  327  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  44.92 
 
 		 357 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  44.6 
 
 		 356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  45.98 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1310  peptide chain release factor 1  50.75 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.123154 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 360 aa  326  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  45.2 
 
 		 362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 356 aa  325  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  46.76 
 
 		 360 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  45.74 
 
 		 357 aa  325  8.000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4635  peptide chain release factor 1  47.08 
 
 		 349 aa  325  8.000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  44.51 
 
 		 362 aa  324  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  46.84 
 
 		 356 aa  324  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  47.78 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  43.47 
 
 		 359 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0609  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 370 aa  323  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.135103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  51.6 
 
 		 363 aa  323  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36081  predicted protein  44.17 
 
 		 358 aa  323  4e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  45.35 
 
 		 362 aa  322  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  47.16 
 
 		 360 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 		 351 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>