More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2203 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 368 aa  749    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  80.33 
 
 		 366 aa  618  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  81.11 
 
 		 364 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3733  peptide chain release factor 1  79.89 
 
 		 370 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.971228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2589  peptide chain release factor 1  78.55 
 
 		 364 aa  585  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  76.94 
 
 		 369 aa  583  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0204  peptide chain release factor 1  78.96 
 
 		 370 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0208  peptide chain release factor 1  78.69 
 
 		 370 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0347  peptide chain release factor 1  59.18 
 
 		 365 aa  457  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1984  peptide chain release factor 1  60.77 
 
 		 365 aa  451  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0196927  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23321  peptide chain release factor 1  58.9 
 
 		 367 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1622  peptide chain release factor 1  57.98 
 
 		 364 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17371  peptide chain release factor 1  59.37 
 
 		 364 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.415096  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17211  peptide chain release factor 1  59.37 
 
 		 364 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17111  peptide chain release factor 1  58.5 
 
 		 364 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241326  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1100  peptide chain release factor 1  56.87 
 
 		 365 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.986414  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16491  peptide chain release factor 1  58.15 
 
 		 365 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0653816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19751  peptide chain release factor 1  56.59 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36081  predicted protein  56.58 
 
 		 358 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17573  predicted protein  57.74 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  48.06 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  48.45 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  48.21 
 
 		 367 aa  365  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 357 aa  364  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  48.45 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  47.73 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  46.24 
 
 		 359 aa  363  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  48.01 
 
 		 355 aa  363  4e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  47.59 
 
 		 356 aa  363  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  47.92 
 
 		 361 aa  362  7.0000000000000005e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 355 aa  361  9e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  47.32 
 
 		 358 aa  361  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  48.17 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  46.65 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  45.38 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  45.38 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 356 aa  358  8e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 359 aa  358  9e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  51.53 
 
 		 358 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  47.89 
 
 		 355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  47.63 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  47.75 
 
 		 357 aa  356  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 358 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  47.73 
 
 		 354 aa  351  8.999999999999999e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  46.5 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  47.35 
 
 		 357 aa  349  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 360 aa  349  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  47.79 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  48.16 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  45.75 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  47.9 
 
 		 355 aa  346  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  46.35 
 
 		 357 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  48.8 
 
 		 359 aa  346  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 355 aa  347  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  45.86 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 		 358 aa  345  7e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 360 aa  345  7e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 361 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  48.5 
 
 		 359 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  45.48 
 
 		 383 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  46.07 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  45.28 
 
 		 361 aa  342  5.999999999999999e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  45.79 
 
 		 363 aa  342  5.999999999999999e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  45.28 
 
 		 361 aa  342  5.999999999999999e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>