More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3645 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 361 aa  738    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  59.71 
 
 		 355 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  60.94 
 
 		 360 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  59.49 
 
 		 355 aa  424  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 355 aa  421  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 358 aa  421  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 358 aa  421  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 358 aa  421  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 363 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  58.81 
 
 		 355 aa  421  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 355 aa  421  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 358 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  56.29 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 358 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  57.71 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  55.71 
 
 		 358 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  55.71 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  56.29 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 		 356 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  54.93 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  57.43 
 
 		 353 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  58.17 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 		 356 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 		 357 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  56.69 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  55.43 
 
 		 359 aa  413  1e-114  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  55.43 
 
 		 359 aa  412  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  57.71 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 361 aa  408  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  58.29 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 		 361 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 355 aa  408  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  55.59 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  56.57 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 361 aa  408  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  57.78 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  58.06 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  56.62 
 
 		 359 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  56.34 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  55.43 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  57.71 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  58.38 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  56.78 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 359 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  56.57 
 
 		 354 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  56.21 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  57.23 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 358 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  55.03 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  57.94 
 
 		 351 aa  401  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  55.34 
 
 		 363 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  56.21 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  54.19 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  55.81 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  51.8 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  51.8 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  56.29 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  53.46 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  58.76 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 		 350 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 		 360 aa  398  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0790  peptide chain release factor 1  53.63 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  53.5 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 		 362 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 355 aa  391  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  56.78 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  57.02 
 
 		 357 aa  391  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 361 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  55.18 
 
 		 360 aa  391  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  55.01 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 		 357 aa  391  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>