More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2868 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  90.66 
 
 
364 aa  679    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  100 
 
 
364 aa  733    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  73.88 
 
 
361 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2796  peptide chain release factor 1  68.16 
 
 
365 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000135616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  60.11 
 
 
355 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  54.44 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  51.53 
 
 
360 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  51.53 
 
 
360 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 
358 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 
356 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  55.34 
 
 
355 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 
357 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
355 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 
357 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  52.65 
 
 
359 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  52.79 
 
 
355 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
358 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
355 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
358 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
358 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
358 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
358 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
358 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
355 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
356 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
358 aa  381  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
359 aa  381  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 
358 aa  378  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
367 aa  378  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  55.77 
 
 
356 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 
355 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 
355 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 
361 aa  375  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 
355 aa  376  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 
358 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 
356 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  53.5 
 
 
355 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  50.97 
 
 
357 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 
358 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
359 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
355 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  52.75 
 
 
363 aa  365  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_002936  DET1210  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 
355 aa  362  4e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  51.68 
 
 
360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  49.13 
 
 
355 aa  362  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 
355 aa  360  2e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  50.97 
 
 
356 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 
362 aa  358  8e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 
370 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  47.77 
 
 
358 aa  358  9e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  50.82 
 
 
383 aa  357  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 
370 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  52.65 
 
 
359 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_993  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.394955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 
355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 
355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 
361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 
361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 
361 aa  355  7.999999999999999e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 
355 aa  354  1e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  51.01 
 
 
372 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 
356 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
360 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
370 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 
356 aa  354  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
355 aa  353  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 
355 aa  352  4e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  49.45 
 
 
361 aa  352  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 
361 aa  352  5.9999999999999994e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  53.09 
 
 
358 aa  352  8e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  48.04 
 
 
357 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  47.63 
 
 
360 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
355 aa  351  1e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 
353 aa  351  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  50.69 
 
 
360 aa  350  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 
359 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1020  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 
355 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  56.15 
 
 
355 aa  349  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  51.13 
 
 
360 aa  349  5e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  50 
 
 
359 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  46.48 
 
 
362 aa  349  5e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  49.04 
 
 
361 aa  348  9e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
355 aa  348  1e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
355 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  47.11 
 
 
362 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0015  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
355 aa  347  2e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0074  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
355 aa  346  3e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
356 aa  346  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 
360 aa  346  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  45.76 
 
 
358 aa  345  6e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  48.48 
 
 
360 aa  345  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  46.67 
 
 
364 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  45.92 
 
 
358 aa  345  8e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  45.92 
 
 
358 aa  345  8e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  48.48 
 
 
363 aa  343  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  46.2 
 
 
358 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 
357 aa  343  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  48.21 
 
 
360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  49.31 
 
 
361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>