More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_36081 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_36081  predicted protein  100 
 
 		 358 aa  737    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  58.38 
 
 		 366 aa  438  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  56.34 
 
 		 364 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  56.58 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  57.54 
 
 		 369 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3733  peptide chain release factor 1  58.87 
 
 		 370 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.971228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2589  peptide chain release factor 1  58.47 
 
 		 364 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0208  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 		 370 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0204  peptide chain release factor 1  57.46 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192839 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0347  peptide chain release factor 1  51.96 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1622  peptide chain release factor 1  53.45 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1984  peptide chain release factor 1  52.79 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0196927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17371  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 		 364 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.415096  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17211  peptide chain release factor 1  52.87 
 
 		 364 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17111  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 		 364 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241326  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23321  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1100  peptide chain release factor 1  51.96 
 
 		 365 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.986414  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16491  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0653816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19751  peptide chain release factor 1  51.96 
 
 		 365 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17573  predicted protein  53.69 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  47.09 
 
 		 370 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  46.8 
 
 		 370 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  46.51 
 
 		 370 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  46.96 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  45.66 
 
 		 357 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  47.38 
 
 		 372 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  44.97 
 
 		 367 aa  335  5.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  45.22 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  45.22 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  44.66 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  45.4 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  46.46 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  46.37 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  45.51 
 
 		 359 aa  332  5e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 		 358 aa  332  8e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  44.92 
 
 		 355 aa  331  9e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  44.92 
 
 		 355 aa  331  9e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  43.34 
 
 		 357 aa  331  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  45.76 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  44.69 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  44.63 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  44.63 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  44.63 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  44.63 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  44.63 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  44.38 
 
 		 359 aa  329  4e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  45.92 
 
 		 357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  44.35 
 
 		 355 aa  328  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  44.03 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  44.35 
 
 		 358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  44.29 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  44.29 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  44.07 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  43.82 
 
 		 358 aa  325  7e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  45.96 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  45.2 
 
 		 355 aa  323  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  42.9 
 
 		 357 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  44.41 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  43.63 
 
 		 357 aa  322  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  43.91 
 
 		 354 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  44.1 
 
 		 357 aa  322  8e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  43.91 
 
 		 355 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  43.61 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  44.92 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 357 aa  320  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  44.48 
 
 		 363 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  42.82 
 
 		 356 aa  318  7.999999999999999e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  46.24 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  43.85 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  43.58 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  43.3 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  43.85 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  43.3 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  42.05 
 
 		 356 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  45.61 
 
 		 355 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  44.76 
 
 		 363 aa  316  4e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  43.45 
 
 		 363 aa  316  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  43.63 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  43.18 
 
 		 361 aa  315  8e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  42.98 
 
 		 360 aa  315  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  44.97 
 
 		 358 aa  315  8e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  42.3 
 
 		 361 aa  315  9e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  43.42 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  43.02 
 
 		 357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  45.13 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  45.35 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  45.35 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  43.42 
 
 		 356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  42.74 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  43.58 
 
 		 362 aa  312  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  43.58 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  43.38 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  43.38 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  42.22 
 
 		 360 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  45.79 
 
 		 356 aa  311  9e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  44.1 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  46.75 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  43.38 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  43.45 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  42.74 
 
 		 361 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>