More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2309 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 358 aa  739    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  75.99 
 
 		 357 aa  576  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  75.7 
 
 		 358 aa  577  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  61.9 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  58.71 
 
 		 359 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  59.1 
 
 		 357 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 355 aa  424  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 		 361 aa  420  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 359 aa  391  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  49.58 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  53.35 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 360 aa  388  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  54.46 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  53.01 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 		 356 aa  381  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  47.59 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  52.33 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  48.09 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  48.09 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  48.16 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  50.59 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 359 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  49.56 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  48.17 
 
 		 355 aa  368  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  51.92 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  48.97 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  49.56 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 		 355 aa  364  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  49.56 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  48.61 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 363 aa  363  3e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 358 aa  362  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 358 aa  362  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  47.47 
 
 		 367 aa  361  9e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 360 aa  361  9e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  48.98 
 
 		 360 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  48.17 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  51.33 
 
 		 359 aa  359  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 358 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 358 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 358 aa  360  3e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  50.74 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 		 363 aa  358  5e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  48.47 
 
 		 355 aa  358  7e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 356 aa  358  8e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1891  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 352 aa  358  8e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.000000000024235 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  46.48 
 
 		 357 aa  358  9.999999999999999e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  52.3 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  48.98 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  47.73 
 
 		 357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  48.16 
 
 		 359 aa  355  5.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 372 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 360 aa  355  7.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 361 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  48.69 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  50.75 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  47.62 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  47.54 
 
 		 362 aa  354  2e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>