More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13608 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  100 
 
 
358 aa  739    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  75.14 
 
 
357 aa  575  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  75.7 
 
 
358 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  59.77 
 
 
357 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  56.34 
 
 
361 aa  435  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  56.46 
 
 
359 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  55.81 
 
 
357 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 
357 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  53.37 
 
 
354 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 
355 aa  396  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 
360 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 
363 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 
356 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  48.88 
 
 
357 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 
357 aa  378  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 
358 aa  378  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 
357 aa  378  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  47.47 
 
 
356 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 
359 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 
361 aa  371  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 
356 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 
358 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 
357 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 
362 aa  364  1e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 
362 aa  364  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  47.03 
 
 
357 aa  364  1e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  48.58 
 
 
356 aa  363  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  48.02 
 
 
355 aa  363  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 
359 aa  362  8e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 
358 aa  360  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  48.75 
 
 
358 aa  360  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 
361 aa  358  6e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 
361 aa  358  6e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 
355 aa  358  8e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  47.94 
 
 
361 aa  358  8e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
355 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  50.77 
 
 
360 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  47.91 
 
 
358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  48.39 
 
 
362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 
360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 
362 aa  355  5e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 
356 aa  355  5e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  49.27 
 
 
364 aa  355  5e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
358 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  45.94 
 
 
360 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  47.73 
 
 
356 aa  354  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 
360 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 
360 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  48.98 
 
 
361 aa  353  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  47.32 
 
 
360 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  47.32 
 
 
360 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  48.41 
 
 
361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  47.73 
 
 
361 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  50 
 
 
353 aa  352  5e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  47.73 
 
 
357 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  46.2 
 
 
355 aa  352  7e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 
355 aa  351  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  47.19 
 
 
355 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 
355 aa  351  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  49.12 
 
 
360 aa  351  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  46.05 
 
 
370 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  46.05 
 
 
370 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  48.66 
 
 
363 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  47.52 
 
 
360 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  47.86 
 
 
358 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 
355 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  46.78 
 
 
360 aa  349  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  46.35 
 
 
355 aa  349  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  48.98 
 
 
360 aa  349  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 
358 aa  349  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  47.58 
 
 
358 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  47.58 
 
 
358 aa  349  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  47.58 
 
 
358 aa  349  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  47.58 
 
 
358 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  47.58 
 
 
358 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 
355 aa  348  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  46.38 
 
 
362 aa  348  7e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  47.23 
 
 
361 aa  348  8e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  49.27 
 
 
362 aa  348  8e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  46.31 
 
 
357 aa  348  8e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  46.35 
 
 
367 aa  348  9e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0096  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 
357 aa  347  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000153667  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  46.02 
 
 
357 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 
355 aa  348  1e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 
355 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  45.1 
 
 
360 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  45.48 
 
 
370 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  47.47 
 
 
358 aa  347  2e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  47.65 
 
 
363 aa  346  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4206  peptide chain release factor 1  46.89 
 
 
362 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  45.94 
 
 
360 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  47.94 
 
 
362 aa  347  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1891  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 
352 aa  346  3e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.000000000024235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 
355 aa  346  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  46.72 
 
 
358 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  47.16 
 
 
355 aa  345  6e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  46.89 
 
 
361 aa  345  6e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2682  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 
357 aa  345  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  47.35 
 
 
362 aa  343  2e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
357 aa  343  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>