More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0753 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  100 
 
 
358 aa  721    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 
360 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 
360 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  57.7 
 
 
358 aa  411  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 
356 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 
358 aa  401  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 
360 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  58.26 
 
 
358 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 
359 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 
355 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  57.3 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
355 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 
358 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 
358 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 
358 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
358 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
358 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 
358 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 
355 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
355 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 
358 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 
356 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 
356 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 
355 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 
359 aa  388  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 
359 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 
358 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 
358 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  55.23 
 
 
355 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 
362 aa  385  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 
358 aa  382  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  53.09 
 
 
359 aa  384  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  55.03 
 
 
355 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 
362 aa  382  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 
355 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 
357 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  53.2 
 
 
359 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  52.19 
 
 
361 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 
356 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 
358 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
367 aa  375  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 
355 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 
356 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
361 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  55.85 
 
 
355 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  55.85 
 
 
355 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 
355 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  53.45 
 
 
360 aa  373  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  53.22 
 
 
358 aa  372  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 
355 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 
357 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 
359 aa  368  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
359 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  53.33 
 
 
355 aa  370  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  50 
 
 
361 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
355 aa  368  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  55.88 
 
 
355 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 
355 aa  370  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 
356 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 
355 aa  368  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 
355 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  47.77 
 
 
360 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 
362 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
364 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 
357 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 
362 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  51.13 
 
 
350 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
359 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 
363 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 
359 aa  363  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  47.62 
 
 
362 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  51.75 
 
 
355 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  52.77 
 
 
355 aa  363  3e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  51.13 
 
 
359 aa  363  3e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  47.77 
 
 
360 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  52.46 
 
 
355 aa  363  3e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2796  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 
365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000135616  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 
358 aa  360  1e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  53.19 
 
 
355 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 
357 aa  360  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 
357 aa  360  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 
361 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 
358 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 
370 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  48.58 
 
 
362 aa  359  5e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  48.58 
 
 
362 aa  359  5e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  53.24 
 
 
355 aa  358  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  51.68 
 
 
351 aa  358  8e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  52.74 
 
 
354 aa  358  8e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  50 
 
 
360 aa  358  8e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  47.77 
 
 
364 aa  358  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  50 
 
 
372 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  46.65 
 
 
360 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4635  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 
361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  50 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 
360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>