More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1747 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 355 aa  710    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  66.48 
 
 		 355 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  62.5 
 
 		 359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  62.5 
 
 		 377 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  63.23 
 
 		 358 aa  448  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  62.29 
 
 		 357 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  64.59 
 
 		 354 aa  448  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  62.75 
 
 		 359 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  63.43 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  61.9 
 
 		 359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  62.57 
 
 		 361 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  62.33 
 
 		 359 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  64.47 
 
 		 361 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  63.17 
 
 		 360 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  62.96 
 
 		 354 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  62.85 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  60.66 
 
 		 359 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  61.73 
 
 		 361 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  59.5 
 
 		 359 aa  436  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  66.77 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  60.94 
 
 		 361 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  61.65 
 
 		 350 aa  431  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  62.25 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  61.32 
 
 		 351 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0646  peptide chain release factor 1  60.85 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 351 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  60.67 
 
 		 361 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0512  peptide chain release factor 1  61.56 
 
 		 361 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  59.61 
 
 		 358 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  60.11 
 
 		 361 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  56.46 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  55.74 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  58.69 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  58.97 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  58.97 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  58.99 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  55.77 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  55.77 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  58.99 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  58.26 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  55.81 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  62.73 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  55.81 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  60.37 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 360 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  57.45 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 360 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  55.43 
 
 		 360 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  62.2 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  60.19 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 355 aa  381  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 363 aa  381  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 		 362 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  64.91 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  58.72 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 362 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  57.93 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  57.91 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0137  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 		 352 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.490525  normal  0.171192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  56.78 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  57.88 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  56.84 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0406  peptide chain release factor 1  57.36 
 
 		 367 aa  381  1e-104  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.795353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  58.18 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  57.45 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  53.52 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  55.81 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  58.95 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  57.32 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>