More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0406 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0406  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 367 aa  752    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.795353  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  64.1 
 
 		 359 aa  457  1e-127  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  61.19 
 
 		 359 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  60.34 
 
 		 359 aa  436  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  59.88 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  56.41 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  57.36 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 		 351 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  56.59 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  56.29 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  54.71 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  55.86 
 
 		 360 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  52.57 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  52.57 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 354 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  52.44 
 
 		 350 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  54.15 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  52.86 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  53.2 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  54.41 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0137  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.490525  normal  0.171192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0646  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 357 aa  362  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 362 aa  362  5.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 362 aa  362  5.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  52.78 
 
 		 351 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  53.33 
 
 		 360 aa  361  9e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  56.29 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 356 aa  359  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 		 353 aa  359  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 		 361 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 361 aa  360  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 359 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  53.35 
 
 		 358 aa  359  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  52.22 
 
 		 351 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 358 aa  359  5e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 361 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  52.22 
 
 		 351 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 361 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 360 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  54.2 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  51.68 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  56.84 
 
 		 359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  51.53 
 
 		 360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 361 aa  355  5e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 361 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 361 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  51.01 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 360 aa  353  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  51.13 
 
 		 356 aa  352  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  51.39 
 
 		 361 aa  352  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 361 aa  352  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 361 aa  352  5.9999999999999994e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  51.6 
 
 		 361 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  53.01 
 
 		 357 aa  352  8e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01186  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  51.67 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1375  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  53.26 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  52.2 
 
 		 367 aa  350  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 361 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  52.49 
 
 		 355 aa  349  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  349  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 360 aa  349  5e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 355 aa  348  6e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1913  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 360 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1547  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 360 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891695  normal  0.256018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1363  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 360 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133324  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1971  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 360 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00228451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1907  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 360 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0341026  normal  0.709349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 360 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 358 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  49.03 
 
 		 361 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  52.78 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>