More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0805 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 367 aa  735    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  60.4 
 
 		 359 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  62.71 
 
 		 355 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  61.35 
 
 		 360 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  60.11 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  59.15 
 
 		 357 aa  434  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 		 356 aa  434  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 		 356 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  61.86 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  58.1 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 		 357 aa  425  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  52.38 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  58.97 
 
 		 358 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 		 356 aa  421  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  58.17 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  57.91 
 
 		 358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  54.15 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  61.93 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  53.72 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  55.85 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  50.69 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 358 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  51.85 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 		 361 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  51.66 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  51.85 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 		 361 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 355 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  58.17 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  53.51 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  51.66 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 358 aa  391  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  59.04 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  52.49 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  51.96 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  49.17 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 		 356 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  51.66 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  53.67 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  52.89 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  51.8 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 361 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  55.85 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  53.67 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  52.91 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  50.68 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  51.54 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  51.24 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  51.25 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>