More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2083 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 356 aa  724    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  64.39 
 
 		 353 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  62.82 
 
 		 357 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  63.74 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  65.63 
 
 		 357 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  61.65 
 
 		 355 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  60.96 
 
 		 356 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  61.36 
 
 		 355 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  60.17 
 
 		 357 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  58.87 
 
 		 359 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  58.87 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  58.59 
 
 		 355 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 356 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  58.81 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  59.26 
 
 		 356 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  60.34 
 
 		 357 aa  433  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 358 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 		 355 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  59.66 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  60.28 
 
 		 355 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 359 aa  427  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  56.37 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  56.37 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 359 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  59.77 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  56.74 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 		 355 aa  411  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  56.62 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  56.77 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  57.83 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 363 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 360 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  56.86 
 
 		 358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 361 aa  401  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  62.78 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  55.31 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 363 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  54.57 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  54.02 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  54.02 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  53.43 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 		 360 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  56.01 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  53.35 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 370 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  55.68 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  51.97 
 
 		 363 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>