More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2999 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 359 aa  719    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  76.97 
 
 		 359 aa  559  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  75.28 
 
 		 360 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  76.97 
 
 		 377 aa  558  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  76.69 
 
 		 357 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  73.88 
 
 		 359 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  73.88 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  72.42 
 
 		 359 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  69.32 
 
 		 359 aa  520  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  60.85 
 
 		 358 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  64 
 
 		 351 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  62.22 
 
 		 360 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  61.84 
 
 		 361 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  62.12 
 
 		 359 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  62.33 
 
 		 355 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  60.34 
 
 		 361 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  62.4 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  63.06 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  61.56 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  63.06 
 
 		 361 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  61.65 
 
 		 354 aa  438  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  59.61 
 
 		 361 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  60.91 
 
 		 350 aa  438  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  61.62 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 		 361 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  60.17 
 
 		 361 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  59.5 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  61.14 
 
 		 360 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 		 351 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  65.03 
 
 		 334 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0646  peptide chain release factor 1  59.32 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  59.27 
 
 		 360 aa  421  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  61.14 
 
 		 351 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  61.14 
 
 		 351 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  60.86 
 
 		 351 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0512  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  56.98 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  57.31 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0137  peptide chain release factor 1  59.83 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.490525  normal  0.171192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  58.63 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  57.73 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  58.28 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  53.37 
 
 		 362 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  53.37 
 
 		 362 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  55.1 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  55.91 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  57.43 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  58.28 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  57.8 
 
 		 356 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  57.8 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  58.79 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  53.17 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  55.75 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  58.15 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  57.54 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  58.01 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  60.12 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  54.02 
 
 		 367 aa  381  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  57.23 
 
 		 359 aa  381  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  59.19 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  54.62 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 362 aa  381  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  52.62 
 
 		 362 aa  383  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  59.19 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  59.81 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  56.57 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  52.29 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  58.57 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  55.2 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  52.35 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  55.74 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  60.62 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 362 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  60 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  56.57 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  58.88 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  57.45 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>