More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0750 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 354 aa  701    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  64.59 
 
 		 355 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  64.66 
 
 		 354 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  64.53 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  61.08 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  61.92 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  60.51 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  60.17 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  60.91 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 		 350 aa  411  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  57.78 
 
 		 361 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  61.54 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  60.92 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  60.49 
 
 		 334 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  53.5 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  57.54 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  60.92 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  61.54 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  58.89 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  59.77 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  61.49 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  61.47 
 
 		 360 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  61.47 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  59.49 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  61.47 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 		 351 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  59.49 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  60.55 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  57.63 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  57.46 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  60.79 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  58.77 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  57.85 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0137  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.490525  normal  0.171192 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  57.4 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  56.21 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0646  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  58.39 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  55.74 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  55.17 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  54.31 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  56.12 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  57.01 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  55.81 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0406  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.795353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  53.63 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  54.19 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  53.63 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  57.4 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  54.9 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  53.64 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  58.54 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  57.73 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  55.96 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  53.93 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  54.91 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1014  peptide chain release factor 1  59.13 
 
 		 352 aa  368  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222491  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  51.69 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0512  peptide chain release factor 1  55.28 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  58.13 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  55.99 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>