More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3170 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 356 aa  732    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  72.11 
 
 		 355 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  67.71 
 
 		 355 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  66.2 
 
 		 356 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  65.92 
 
 		 355 aa  498  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  63.94 
 
 		 355 aa  488  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  63.94 
 
 		 355 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  63.66 
 
 		 355 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  63.74 
 
 		 358 aa  484  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  64.02 
 
 		 358 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  64.02 
 
 		 358 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  64.02 
 
 		 358 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  64.23 
 
 		 355 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  64.02 
 
 		 358 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  64.02 
 
 		 358 aa  485  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  64.02 
 
 		 358 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  66.2 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  63.38 
 
 		 355 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  63.82 
 
 		 359 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  61.02 
 
 		 360 aa  475  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  61.02 
 
 		 360 aa  475  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  63.82 
 
 		 358 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  61.82 
 
 		 360 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  60.73 
 
 		 355 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 		 355 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 		 356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 359 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 357 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  58.43 
 
 		 355 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  63.1 
 
 		 356 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 355 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  61.93 
 
 		 356 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  59.5 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 356 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  64.41 
 
 		 355 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  60.89 
 
 		 359 aa  435  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 356 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  63.53 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  58.69 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  60.34 
 
 		 359 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 		 357 aa  428  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  62.89 
 
 		 357 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  56.46 
 
 		 358 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  56.34 
 
 		 361 aa  425  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  58.07 
 
 		 358 aa  425  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 353 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 362 aa  425  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 		 359 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  57.71 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  58.07 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 		 356 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  55.14 
 
 		 363 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 		 363 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  55.74 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  56.62 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  52.65 
 
 		 359 aa  403  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_993  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.394955  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  53.67 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  54.62 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  54.62 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  54.62 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1210  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  56.57 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1020  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  60.75 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  53.24 
 
 		 360 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  57.59 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  55.91 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  54.44 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>