More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0137 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0137  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 352 aa  699    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.490525  normal  0.171192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1014  peptide chain release factor 1  76.97 
 
 		 352 aa  471  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222491  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  64.37 
 
 		 351 aa  435  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  60.11 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  59.48 
 
 		 350 aa  415  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  59.83 
 
 		 359 aa  414  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  61.92 
 
 		 351 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  60.47 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  59.89 
 
 		 360 aa  408  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  60.35 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  60.47 
 
 		 351 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  60.47 
 
 		 351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  60.98 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  59.32 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  56.98 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  59.71 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  58.82 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  59.54 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  59.66 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  59.66 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 		 357 aa  391  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  56.77 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  59.43 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  57.91 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  54.89 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  56.01 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  56.41 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  57.88 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  54.57 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0406  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  53.43 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  54.57 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  55.3 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  57.76 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  52.51 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  51.13 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  57.59 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  57.01 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  54.18 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  55.3 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  56.18 
 
 		 357 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 		 360 aa  362  6e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  51.43 
 
 		 360 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  51.43 
 
 		 360 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  51.43 
 
 		 360 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 		 363 aa  362  7.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  52.01 
 
 		 360 aa  362  8e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 355 aa  361  9e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  53.43 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  54.25 
 
 		 356 aa  359  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  51.43 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  56.97 
 
 		 359 aa  359  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  51.43 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  358  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 360 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 360 aa  358  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 361 aa  358  8e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  52.39 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  50.56 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  56.38 
 
 		 355 aa  355  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 361 aa  355  5.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 		 360 aa  355  5.999999999999999e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 361 aa  355  5.999999999999999e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  51.44 
 
 		 358 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  52.57 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0646  peptide chain release factor 1  53.03 
 
 		 357 aa  354  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.249903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>