More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3850 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  95.49 
 
 
355 aa  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  95.21 
 
 
358 aa  702    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  95.21 
 
 
358 aa  702    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  95.21 
 
 
358 aa  702    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  94.37 
 
 
355 aa  695    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  95.21 
 
 
358 aa  702    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  94.37 
 
 
358 aa  696    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  95.21 
 
 
358 aa  702    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  95.21 
 
 
358 aa  702    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  95.49 
 
 
355 aa  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  100 
 
 
355 aa  726    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  80.51 
 
 
358 aa  585  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  81.07 
 
 
358 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  66.67 
 
 
358 aa  491  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  64.23 
 
 
356 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  66.67 
 
 
358 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  66.67 
 
 
358 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  61.76 
 
 
355 aa  475  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  67.32 
 
 
356 aa  471  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  60.56 
 
 
356 aa  465  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  61.93 
 
 
357 aa  467  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 
362 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  60.85 
 
 
355 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 
360 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 
360 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  61.02 
 
 
359 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  60.34 
 
 
359 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  58.69 
 
 
359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  60.97 
 
 
355 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 
355 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 
362 aa  437  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  58.31 
 
 
356 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  58.69 
 
 
360 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 
356 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 
359 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 
357 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 
355 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  56.78 
 
 
355 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  56.29 
 
 
361 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 
357 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 
355 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 
361 aa  411  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  58.81 
 
 
356 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 
355 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 
358 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
356 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
358 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  53.67 
 
 
357 aa  408  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 
355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 
356 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 
367 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 
355 aa  401  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  56.55 
 
 
359 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 
363 aa  399  9.999999999999999e-111  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  55.04 
 
 
363 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 
359 aa  401  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 
359 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 
358 aa  396  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_993  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 
355 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.394955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 
354 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  58.69 
 
 
355 aa  398  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  55.71 
 
 
355 aa  395  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 
362 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1210  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 
355 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 
363 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 
355 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  54.89 
 
 
358 aa  392  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 
357 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1020  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 
355 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
357 aa  388  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 
356 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  52.29 
 
 
363 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 
355 aa  386  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 
360 aa  387  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 
363 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
364 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  53.67 
 
 
360 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  51.97 
 
 
355 aa  382  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 
360 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  54.05 
 
 
361 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 
360 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 
360 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  53.58 
 
 
360 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 
361 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 
353 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 
361 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 
360 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 
360 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 
360 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
357 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 
359 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  51.75 
 
 
370 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  54.31 
 
 
354 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0790  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 
362 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  51.75 
 
 
370 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 
362 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 
360 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 
357 aa  380  1e-104  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>