More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2530 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 360 aa  710    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  70.87 
 
 		 354 aa  494  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  70.67 
 
 		 355 aa  490  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  63.43 
 
 		 355 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  63.44 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  60.94 
 
 		 361 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  61.33 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  61.84 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  61.08 
 
 		 354 aa  425  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  61.03 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  59.27 
 
 		 359 aa  421  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 		 377 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  59.5 
 
 		 359 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  58.38 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  57.82 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  63.11 
 
 		 334 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 359 aa  409  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0406  peptide chain release factor 1  59.88 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.795353  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 		 350 aa  408  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0646  peptide chain release factor 1  60.17 
 
 		 357 aa  408  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  60.11 
 
 		 359 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  59.27 
 
 		 361 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  59.55 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  58.77 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  59.55 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  59.55 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  59.32 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  58.66 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  56.57 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  60.98 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  56.16 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 		 361 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  62.69 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 362 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 362 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  62.08 
 
 		 351 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 361 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  54.75 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  62.08 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  53.74 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  56.86 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  53.43 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  56.18 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  58.17 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  58.95 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  55.22 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  53.74 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  54.85 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  57.8 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  55.62 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  55.34 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0137  peptide chain release factor 1  57.88 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.490525  normal  0.171192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  53.01 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  56.41 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  55.91 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  52.63 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  52.63 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  56.62 
 
 		 361 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  55.34 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  54.85 
 
 		 361 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  54.86 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  58.73 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  52.63 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>