More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0980 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 334 aa  677    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0646  peptide chain release factor 1  66.47 
 
 		 357 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  66.77 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  65.64 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  64.72 
 
 		 359 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  63.39 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  64.11 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  64.51 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  65.03 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  65.52 
 
 		 351 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  65.52 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  61.61 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  61.61 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  64.11 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  65.52 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  61.68 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  63.11 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  60.55 
 
 		 359 aa  413  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  62.84 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  62.31 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  60.49 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  62.24 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  59.09 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  60.8 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  62.54 
 
 		 361 aa  394  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  61.96 
 
 		 360 aa  391  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  62.24 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  62.24 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  58.1 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  59.45 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  59.57 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  61.42 
 
 		 361 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  58.95 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  60.24 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  60.44 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0406  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.795353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 		 359 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 351 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  57.01 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  57.89 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  58.21 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  56.97 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  56.97 
 
 		 360 aa  374  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  56.97 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  58.73 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  57.36 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04548  peptide chain release factor 1  59.44 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  55.72 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  57.28 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  59.88 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  57.36 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  57.91 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  57.28 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  58.21 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  57.63 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2123  peptide chain release factor 1  58.18 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000913582  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2212  peptide chain release factor 1  57.88 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.189214  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  57.01 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  56.29 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  56.75 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  56.97 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  55.32 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  55.32 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  56.19 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  55.05 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  59.13 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0512  peptide chain release factor 1  59.26 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  56.35 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  55.89 
 
 		 362 aa  368  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  56.97 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  55.72 
 
 		 358 aa  368  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  55.72 
 
 		 358 aa  368  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  56.97 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0721  peptide chain release factor 1  58.91 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01186  peptide chain release factor 1  59.01 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  59.01 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  59.01 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  57.32 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  57.28 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  59.01 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  59.01 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  55.35 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  56.76 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1375  peptide chain release factor 1  59.01 
 
 		 360 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017097  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  59.01 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  59.01 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  59.01 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0137  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.490525  normal  0.171192 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  53.73 
 
 		 355 aa  364  1e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  58.26 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>