More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0451 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  100 
 
 
357 aa  728    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  81.97 
 
 
357 aa  591  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  74.01 
 
 
356 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  72.96 
 
 
357 aa  535  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  62.82 
 
 
356 aa  479  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  63.53 
 
 
353 aa  475  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  64.02 
 
 
356 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  61.9 
 
 
355 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  61.34 
 
 
355 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  61.52 
 
 
359 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 
355 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  61.52 
 
 
359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 
356 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  60.56 
 
 
354 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  56.18 
 
 
362 aa  431  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 
363 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  56.58 
 
 
359 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  58.82 
 
 
355 aa  428  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  59.04 
 
 
363 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 
357 aa  428  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 
361 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  55.62 
 
 
362 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  58.4 
 
 
360 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  58.07 
 
 
363 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  58.69 
 
 
360 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  55.34 
 
 
362 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 
355 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 
360 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 
361 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  57.7 
 
 
360 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 
361 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 
359 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 
355 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  58.07 
 
 
360 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  58.29 
 
 
362 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 
355 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 
360 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 
360 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 
360 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 
362 aa  415  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  58.17 
 
 
361 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0136  peptide chain release factor 1  55.74 
 
 
359 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.056338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0790  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 
362 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 
360 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 
360 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  55.17 
 
 
362 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  55.17 
 
 
362 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  58.15 
 
 
361 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  55.52 
 
 
357 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 
356 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  56.86 
 
 
360 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 
356 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  53.93 
 
 
360 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  55.06 
 
 
360 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
362 aa  412  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  58.57 
 
 
360 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 
355 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
360 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  56.18 
 
 
361 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0148  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 
359 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.570569  normal  0.18601 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 
360 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  57.76 
 
 
360 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 
360 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 
363 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
360 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  53.93 
 
 
360 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
361 aa  408  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  55.71 
 
 
361 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 
360 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  56.34 
 
 
355 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 
360 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 
360 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 
360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 
363 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  55.68 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  54.15 
 
 
367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 
355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  56.86 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  56.46 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  55.18 
 
 
360 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  57.82 
 
 
361 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  55.34 
 
 
360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  55.68 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  57.31 
 
 
359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 
361 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  55.18 
 
 
360 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 
363 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  55.18 
 
 
360 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 
360 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 
357 aa  402  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 
363 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>