More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0137 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 361 aa  720    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  88.64 
 
 		 361 aa  621  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  87.53 
 
 		 361 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  87.53 
 
 		 361 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  84.72 
 
 		 359 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  84.17 
 
 		 359 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  71.39 
 
 		 360 aa  518  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  70.62 
 
 		 358 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  66.48 
 
 		 361 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  65.46 
 
 		 361 aa  484  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  66.39 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  64.8 
 
 		 358 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  65.14 
 
 		 361 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  64.27 
 
 		 361 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  66.67 
 
 		 360 aa  471  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  62.4 
 
 		 377 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  62.4 
 
 		 359 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  62.4 
 
 		 357 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  61.84 
 
 		 359 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  61.28 
 
 		 359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  62.67 
 
 		 359 aa  444  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  61.56 
 
 		 359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  61.28 
 
 		 360 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0512  peptide chain release factor 1  62.6 
 
 		 361 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  61.52 
 
 		 350 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  61 
 
 		 355 aa  430  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  58.31 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  61.84 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  61.47 
 
 		 354 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  60.67 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  60.8 
 
 		 363 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  60.91 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  61.65 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  58.77 
 
 		 363 aa  411  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  61.93 
 
 		 351 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  62.22 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  62.22 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  58.22 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 361 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  62.31 
 
 		 334 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  58.71 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  59.83 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  58.59 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  56.62 
 
 		 360 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  58.99 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  59.72 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  60.42 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  52.76 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  57.87 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  60.24 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  55.76 
 
 		 359 aa  388  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  59.77 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  61.03 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  55 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 362 aa  388  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  58.07 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 		 355 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  54.72 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 		 362 aa  388  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  55.15 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0137  peptide chain release factor 1  59.32 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.490525  normal  0.171192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  55.24 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 355 aa  381  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  59.02 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  55.18 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1913  peptide chain release factor 1  56.39 
 
 		 360 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>