More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1036 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  95.22 
 
 		 359 aa  689    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 357 aa  723    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  95.22 
 
 		 377 aa  687    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  78.09 
 
 		 359 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  75.28 
 
 		 360 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  76.69 
 
 		 359 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  75.28 
 
 		 359 aa  551  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  74.72 
 
 		 359 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  74.16 
 
 		 359 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  64.02 
 
 		 360 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  64.49 
 
 		 351 aa  458  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  62.4 
 
 		 361 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  62.29 
 
 		 355 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  63.66 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  63.82 
 
 		 358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  60.56 
 
 		 358 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  60.61 
 
 		 361 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  61.06 
 
 		 350 aa  444  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  63.51 
 
 		 359 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  63.79 
 
 		 359 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 		 361 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  59.05 
 
 		 361 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 		 361 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  61.84 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  60.46 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  61.84 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  61.56 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  60.57 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 		 351 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 351 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  58.1 
 
 		 355 aa  421  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 351 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0646  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 		 357 aa  418  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  57.82 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  61.68 
 
 		 334 aa  415  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0512  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  61.09 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  56.16 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  60.79 
 
 		 354 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 358 aa  391  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 		 361 aa  391  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  60.17 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  58.43 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 360 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  54.9 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  55.1 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  57.02 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  54.89 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  55.85 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 356 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  52.54 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  53.72 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  55.43 
 
 		 356 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  58.54 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0137  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.490525  normal  0.171192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  58.54 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 363 aa  378  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  52.3 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  53.03 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 356 aa  371  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>