More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2791 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 353 aa  725    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  64.39 
 
 		 356 aa  487  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  65.34 
 
 		 355 aa  485  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  63.53 
 
 		 357 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  63.82 
 
 		 357 aa  454  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  64.67 
 
 		 357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  59.54 
 
 		 356 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  59.14 
 
 		 356 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  58.19 
 
 		 356 aa  424  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  60.66 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  57.83 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  61.13 
 
 		 356 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  60.66 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  56.98 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  57.43 
 
 		 361 aa  421  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 359 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  57.95 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  58.24 
 
 		 355 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  55.68 
 
 		 361 aa  408  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 		 363 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  57.27 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  55.81 
 
 		 361 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  55.81 
 
 		 361 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  55.81 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 		 355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  56.03 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 370 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  53.6 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 362 aa  394  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 363 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  54.99 
 
 		 360 aa  394  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  54.02 
 
 		 362 aa  391  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  54.02 
 
 		 362 aa  391  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 362 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 362 aa  391  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 360 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2072  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 360 aa  388  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 355 aa  388  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  51.85 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01186  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0790  peptide chain release factor 1  52.3 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1363  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  56.32 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1547  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891695  normal  0.256018 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 362 aa  383  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 367 aa  381  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1907  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0341026  normal  0.709349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1971  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00228451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  54.7 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1375  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  53.3 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>