More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0452 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  100 
 
 
362 aa  737    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  69.17 
 
 
362 aa  532  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  64.35 
 
 
357 aa  492  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  64.15 
 
 
356 aa  487  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  62.25 
 
 
357 aa  481  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  63.1 
 
 
359 aa  480  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  62.82 
 
 
359 aa  477  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  59.72 
 
 
358 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 
355 aa  461  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 
358 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 
358 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 
358 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 
355 aa  461  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 
358 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  59.44 
 
 
358 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 
358 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 
355 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  59.66 
 
 
355 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  59.55 
 
 
358 aa  444  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  58.71 
 
 
358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  59.55 
 
 
358 aa  444  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  59.1 
 
 
358 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 
359 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 
355 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  58.97 
 
 
360 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 
356 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 
356 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  52.38 
 
 
367 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  53.67 
 
 
356 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
360 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
360 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  60.62 
 
 
358 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 
357 aa  420  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
357 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  54.75 
 
 
358 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  52.39 
 
 
357 aa  408  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 
355 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 
355 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 
355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 
356 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 
359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  53.74 
 
 
355 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 
363 aa  402  1e-111  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 
363 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 
359 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 
355 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 
360 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  55.81 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 
355 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  52.81 
 
 
363 aa  395  1e-109  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 
359 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 
358 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 
355 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 
355 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  53.03 
 
 
372 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 
356 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 
355 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
361 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
354 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 
356 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 
360 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 
355 aa  388  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 
355 aa  385  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  52.23 
 
 
363 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 
358 aa  385  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 
360 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 
353 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  51.96 
 
 
360 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 
355 aa  384  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 
356 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
357 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 
363 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 
360 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
370 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 
360 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 
361 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
360 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 
360 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  50.69 
 
 
361 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  50.69 
 
 
361 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
370 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 
355 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  53.63 
 
 
361 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 
356 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
370 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 
354 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
360 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  52.77 
 
 
362 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  52.77 
 
 
362 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
360 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  52.49 
 
 
362 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 
360 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
360 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
363 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 
355 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 
360 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 
355 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  51.91 
 
 
362 aa  376  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  51.26 
 
 
360 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 
360 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0384277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>