More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0793 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  95.54 
 
 		 359 aa  702    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 359 aa  729    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  77.31 
 
 		 357 aa  578  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  63.1 
 
 		 362 aa  480  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  62.22 
 
 		 362 aa  464  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  63.03 
 
 		 356 aa  462  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 		 358 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  60.91 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  60.17 
 
 		 358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  60.34 
 
 		 355 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 		 355 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  59.89 
 
 		 358 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  59.89 
 
 		 358 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  59.89 
 
 		 358 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 		 355 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  59.89 
 
 		 358 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  59.89 
 
 		 358 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  57.42 
 
 		 357 aa  440  9.999999999999999e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  58.71 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  56.37 
 
 		 355 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  56.74 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  54.15 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  58.99 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  51.83 
 
 		 357 aa  394  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  53.09 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 357 aa  391  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  52.22 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  52.22 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 355 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  52.79 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  52.79 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  51.12 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  52.51 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  52.51 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1044  peptide chain release factor 1  53.49 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 		 363 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 359 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 372 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  51.53 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  52.49 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  52.49 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  51.53 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  49.73 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  48.04 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  48.04 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  52.17 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  50.97 
 
 		 360 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  52.63 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  52.34 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  48.59 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>