More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0702 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  100 
 
 
355 aa  729    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  71.83 
 
 
359 aa  551  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  65.92 
 
 
357 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  64.12 
 
 
357 aa  498  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  56.62 
 
 
357 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 
359 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 
356 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 
358 aa  424  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 
357 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 
354 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 
356 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
358 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
358 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
358 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
358 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
358 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 
355 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 
358 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 
361 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  54.52 
 
 
357 aa  398  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 
358 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  56.21 
 
 
358 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 
357 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 
363 aa  396  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 
358 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
355 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 
356 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 
360 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  52.56 
 
 
360 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  54.9 
 
 
360 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 
357 aa  388  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  52.39 
 
 
355 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 
356 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 
356 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2682  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 
357 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 
355 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  52.44 
 
 
363 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 
355 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  51.4 
 
 
358 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  50.73 
 
 
355 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 
355 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 
355 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 
357 aa  378  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 
356 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 
362 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 
357 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 
360 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 
367 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 
358 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 
357 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  52.4 
 
 
359 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 
364 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0096  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
357 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000153667  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 
361 aa  372  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
370 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 
356 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 
355 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  51.9 
 
 
360 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  52.79 
 
 
361 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
360 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  51.43 
 
 
360 aa  368  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  51.6 
 
 
361 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 
355 aa  368  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 
359 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 
361 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 
372 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 
360 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
370 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 
360 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08900  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 
357 aa  368  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000087001  normal  0.899711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 
360 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 
357 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 
363 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 
360 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 
358 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 
361 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 
360 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 
360 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  54.19 
 
 
363 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  54.19 
 
 
363 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 
360 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 
363 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 
360 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 
364 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  51.8 
 
 
359 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 
352 aa  369  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 
355 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 
362 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 
362 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
370 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 
353 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 
358 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 
358 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>