More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4635 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4635  peptide chain release factor 1  100 
 
 
349 aa  697    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  57.02 
 
 
364 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  56.18 
 
 
355 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 
356 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 
356 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 
360 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 
360 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  52.6 
 
 
357 aa  362  4e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  55.94 
 
 
355 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1891  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 
352 aa  358  6e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.000000000024235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  52.6 
 
 
358 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 
358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 
372 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 
370 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 
355 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  51.9 
 
 
355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  54.09 
 
 
358 aa  352  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 
355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 
355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  51.45 
 
 
358 aa  352  7e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  51.45 
 
 
358 aa  352  7e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  51.45 
 
 
358 aa  352  7e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  51.45 
 
 
358 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  51.45 
 
 
358 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  50 
 
 
357 aa  350  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 
355 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 
355 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  50 
 
 
356 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 
363 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  51.16 
 
 
358 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  52.23 
 
 
370 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  52.6 
 
 
360 aa  350  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  51.93 
 
 
370 aa  348  6e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  50.75 
 
 
359 aa  348  6e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  51.86 
 
 
352 aa  348  7e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  51.54 
 
 
363 aa  344  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  50 
 
 
356 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 
355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  48.47 
 
 
355 aa  341  8e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 
358 aa  340  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 
358 aa  340  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 
358 aa  340  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  49.56 
 
 
359 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  47.9 
 
 
355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  51.87 
 
 
355 aa  339  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 
358 aa  339  4e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  49.56 
 
 
359 aa  338  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 
361 aa  338  9.999999999999999e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 
361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 
355 aa  336  2.9999999999999997e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 
356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  49.27 
 
 
358 aa  335  5e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 
356 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  47.34 
 
 
355 aa  335  9e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 
355 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  47.09 
 
 
356 aa  333  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 
354 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  45.35 
 
 
354 aa  333  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  49.7 
 
 
361 aa  332  6e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08900  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 
357 aa  332  6e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000087001  normal  0.899711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  46.05 
 
 
359 aa  332  7.000000000000001e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  53.18 
 
 
358 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 
363 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 
359 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 
360 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  48.12 
 
 
362 aa  330  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  48.12 
 
 
358 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  48.55 
 
 
353 aa  330  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  51.62 
 
 
355 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  48.42 
 
 
360 aa  329  4e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  48.56 
 
 
361 aa  329  4e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  48.16 
 
 
362 aa  328  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  47.99 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  46.74 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  48.1 
 
 
360 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  51.02 
 
 
359 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  49.26 
 
 
355 aa  326  3e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  45.48 
 
 
358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  52.21 
 
 
361 aa  325  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  49 
 
 
356 aa  325  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 
357 aa  325  6e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  50.45 
 
 
361 aa  325  7e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  50.61 
 
 
355 aa  324  1e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  49.55 
 
 
360 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  46.26 
 
 
362 aa  325  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 
363 aa  323  2e-87  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  51.02 
 
 
359 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  51.18 
 
 
360 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  47.13 
 
 
355 aa  323  3e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  50.45 
 
 
361 aa  323  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  51.86 
 
 
361 aa  322  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  49.41 
 
 
360 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 
357 aa  322  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  50 
 
 
355 aa  322  7e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 
357 aa  322  7e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  48.96 
 
 
360 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1310  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 
355 aa  322  9.000000000000001e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.123154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  52.17 
 
 
356 aa  321  9.000000000000001e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>