More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1652 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 364 aa  727    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4635  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 		 349 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  56.23 
 
 		 355 aa  381  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  54.31 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  50.73 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  50.58 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  51.73 
 
 		 360 aa  362  6e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  55.2 
 
 		 355 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  53.3 
 
 		 352 aa  360  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 358 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  48.69 
 
 		 360 aa  359  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  48.69 
 
 		 360 aa  359  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  51.6 
 
 		 356 aa  359  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  51.17 
 
 		 357 aa  359  5e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  48.99 
 
 		 359 aa  358  8e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1891  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.000000000024235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  52.92 
 
 		 355 aa  355  5e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  53.01 
 
 		 355 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  51.73 
 
 		 355 aa  355  7.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  48.27 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  47.54 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  52.62 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 357 aa  353  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08900  peptide chain release factor 1  53.94 
 
 		 357 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000087001  normal  0.899711 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 		 360 aa  352  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  48.97 
 
 		 358 aa  352  8e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 355 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  49.56 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  48.85 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 359 aa  349  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 361 aa  349  4e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 358 aa  349  5e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 358 aa  349  5e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  51.6 
 
 		 360 aa  348  7e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  51.03 
 
 		 356 aa  348  7e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 		 353 aa  348  7e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  46.69 
 
 		 362 aa  348  7e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 		 350 aa  348  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 355 aa  347  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 363 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  51.46 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  48.13 
 
 		 358 aa  346  3e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  47.5 
 
 		 358 aa  346  5e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  50.73 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 		 357 aa  345  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  48.4 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 357 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  49.56 
 
 		 359 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  50.44 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  49.27 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  342  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  51.16 
 
 		 355 aa  342  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  54 
 
 		 363 aa  342  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 360 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 360 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 360 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  52.74 
 
 		 356 aa  342  7e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  52.44 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_993  peptide chain release factor 1  48.68 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.394955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  46.42 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  48.56 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1310  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.123154 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  47.75 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  47.4 
 
 		 361 aa  338  5.9999999999999996e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  51.35 
 
 		 370 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 355 aa  338  9e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 370 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  52.29 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  50.77 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  49.41 
 
 		 358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  47.99 
 
 		 360 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2796  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 365 aa  335  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000135616  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 356 aa  335  7e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 361 aa  335  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0015  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 355 aa  335  7.999999999999999e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  47.21 
 
 		 362 aa  335  9e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1808  peptide chain release factor 1  53.06 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>