More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14260 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 352 aa  719    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1891  peptide chain release factor 1  84.09 
 
 		 352 aa  620  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.000000000024235 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08900  peptide chain release factor 1  76.84 
 
 		 357 aa  569  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000087001  normal  0.899711 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1310  peptide chain release factor 1  67.89 
 
 		 355 aa  474  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.123154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  52.44 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  57.45 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  53.37 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  51.99 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 358 aa  368  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  52.65 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 357 aa  361  9e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  52.31 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  51.41 
 
 		 357 aa  359  5e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  47.8 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 362 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  54.97 
 
 		 359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  49.27 
 
 		 355 aa  355  5e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 359 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  53.19 
 
 		 363 aa  352  5e-96  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 363 aa  352  8e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  47.71 
 
 		 362 aa  351  8e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 355 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 361 aa  350  1e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  53.3 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 358 aa  349  4e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  50.89 
 
 		 355 aa  349  5e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 		 357 aa  348  7e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4635  peptide chain release factor 1  51.86 
 
 		 349 aa  348  7e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  48.97 
 
 		 354 aa  348  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 		 357 aa  348  8e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 357 aa  347  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 360 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  48.57 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 358 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 358 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  51.18 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  51.18 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 		 358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  48.29 
 
 		 370 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  47.89 
 
 		 358 aa  342  7e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  48.83 
 
 		 361 aa  342  7e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  48.29 
 
 		 370 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  48.29 
 
 		 370 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  51.03 
 
 		 363 aa  341  9e-93  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2796  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 365 aa  341  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000135616  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  48.01 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  46.8 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 		 363 aa  339  5e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  49.41 
 
 		 360 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 357 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  48.57 
 
 		 356 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  48.42 
 
 		 360 aa  338  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 360 aa  338  7e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  48.83 
 
 		 355 aa  338  9e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  50.44 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 357 aa  337  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  52.83 
 
 		 361 aa  337  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  50.44 
 
 		 355 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  52.5 
 
 		 358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  52.35 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>