More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1618 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 355 aa  719    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  82 
 
 		 355 aa  600  1e-170  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  81.43 
 
 		 355 aa  597  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1719  peptide chain release factor 1  78.86 
 
 		 355 aa  558  1e-158  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  74.08 
 
 		 355 aa  535  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  73.52 
 
 		 355 aa  532  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  75.14 
 
 		 355 aa  533  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0015  peptide chain release factor 1  74.08 
 
 		 355 aa  531  1e-149  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0074  peptide chain release factor 1  68.56 
 
 		 355 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  66 
 
 		 355 aa  485  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  53.93 
 
 		 361 aa  391  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  59.76 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  55.01 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  59.46 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  55.3 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  53.8 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  51.97 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 357 aa  378  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  55.62 
 
 		 360 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  55.33 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 361 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  53.87 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  53.87 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  53.07 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  53.87 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  51.97 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  53.96 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 361 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  53.89 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  55.87 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  54.76 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  53.6 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  53.31 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  53.6 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 		 358 aa  371  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  53.62 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  52.74 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 		 358 aa  371  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  53.58 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  52.86 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  55.16 
 
 		 355 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  54.18 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  52.86 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  52.15 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  54.76 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  52.86 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  53.31 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  52.16 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  53.31 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 		 356 aa  368  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  52.86 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  52.15 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  54.62 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  53.31 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  52.01 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 357 aa  368  1e-100  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  56.33 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  51.87 
 
 		 363 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  51.87 
 
 		 363 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  52.45 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  52.45 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>