More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0144 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 363 aa  738    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  81.54 
 
 		 363 aa  620  1e-176  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  55.91 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  55.62 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  55.62 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  55.62 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  55.62 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  55.62 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  55.04 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  55.62 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  55.62 
 
 		 358 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  54.47 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  55.04 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  52.81 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0003  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  53.07 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  55.31 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  54.76 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  52.79 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  53.07 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  53.07 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  55.31 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  51.96 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  54.36 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  55.71 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  52.51 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  52.51 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  55.69 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  55.69 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  53.26 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  52.12 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  51.87 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  53.07 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  52.24 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  51.91 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  55.25 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  52.44 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf295  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.410445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  49.04 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  49.04 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 355 aa  364  1e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  54.01 
 
 		 359 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 360 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 360 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  52.4 
 
 		 355 aa  364  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 363 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 360 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  50.73 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  51.74 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 		 360 aa  362  4e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 360 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 360 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 360 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  49.02 
 
 		 360 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  361  9e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 362 aa  361  1e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 362 aa  361  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  49.17 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  49.55 
 
 		 357 aa  360  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  52.38 
 
 		 361 aa  359  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01186  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  50.14 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 355 aa  359  5e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1913  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 360 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>