More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0836 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 356 aa  720    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  50.97 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  55.23 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  55.26 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0279  peptide chain release factor 1  53.89 
 
 		 347 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.156801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  52.6 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  55.14 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1395  peptide chain release factor 1  54.23 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  52.3 
 
 		 357 aa  371  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  51.86 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  50.85 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  50.45 
 
 		 356 aa  362  8e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 358 aa  361  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  49.7 
 
 		 370 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  49.7 
 
 		 370 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 360 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  52.06 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  50.97 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  52.55 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  51.59 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  50.58 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1420  peptide chain release factor 1  66.8 
 
 		 342 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 360 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 360 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  49.7 
 
 		 355 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  47.7 
 
 		 355 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  48.85 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1466  peptide chain release factor 1  65.57 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  349  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 357 aa  349  4e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 356 aa  348  6e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  51.39 
 
 		 359 aa  348  7e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  53.51 
 
 		 359 aa  348  7e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  48.81 
 
 		 372 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  49.26 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  50.9 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  48.57 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  49.27 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  50.46 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  49.27 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  48.29 
 
 		 360 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 361 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 355 aa  346  3e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  46.05 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  48 
 
 		 363 aa  345  7e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 358 aa  345  8e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1210  peptide chain release factor 1  49.7 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 		 362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_993  peptide chain release factor 1  49.7 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.394955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  47.71 
 
 		 360 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  51.65 
 
 		 357 aa  342  4e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  48.81 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  48.81 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 363 aa  342  5e-93  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 355 aa  342  8e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 		 355 aa  342  8e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  47.59 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  51.51 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  47.59 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  48.06 
 
 		 355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  47.43 
 
 		 361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>