More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0599 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 360 aa  718    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13608  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  54.17 
 
 		 357 aa  398  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  54.9 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  52 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 		 363 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  53.26 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  56.98 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  55.3 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  53.58 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  53.58 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  54.09 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  53.3 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  54.73 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  53.3 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 372 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  53.37 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  51.39 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 359 aa  381  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  54.19 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 358 aa  381  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 354 aa  378  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  53.91 
 
 		 360 aa  378  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2682  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 362 aa  371  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 362 aa  371  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  53.91 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  51.85 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  52.44 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08900  peptide chain release factor 1  54.47 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000087001  normal  0.899711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0096  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  50.71 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  53.3 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  53.89 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  53.87 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  51.67 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  51.96 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  52.15 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 355 aa  364  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 355 aa  364  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1310  peptide chain release factor 1  56.43 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.123154 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 		 359 aa  363  3e-99  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 359 aa  362  4e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  49.45 
 
 		 361 aa  363  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  51.66 
 
 		 351 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 359 aa  362  6e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  50.97 
 
 		 359 aa  362  6e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  52.51 
 
 		 358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  50.97 
 
 		 377 aa  361  8e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  52.65 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 359 aa  359  3e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>