More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0063 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 355 aa  713    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  69.49 
 
 		 355 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  65.25 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  64.41 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  65.34 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  60.85 
 
 		 360 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  60.85 
 
 		 360 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  61.13 
 
 		 357 aa  464  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  64.77 
 
 		 355 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  62.82 
 
 		 355 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  61.93 
 
 		 367 aa  460  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  62.99 
 
 		 355 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  59.77 
 
 		 359 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  65.35 
 
 		 356 aa  448  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  59.26 
 
 		 359 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  62.78 
 
 		 356 aa  450  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  61.25 
 
 		 360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  62.04 
 
 		 358 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  60.97 
 
 		 356 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  63.07 
 
 		 355 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  60.39 
 
 		 357 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  61.76 
 
 		 356 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  58.76 
 
 		 361 aa  441  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  57.83 
 
 		 355 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  61.65 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  57.83 
 
 		 355 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  58.69 
 
 		 355 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  60.91 
 
 		 355 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 355 aa  437  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 355 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  57.83 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  60.23 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  60.8 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  58.24 
 
 		 355 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 		 358 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  58.81 
 
 		 357 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  62.07 
 
 		 360 aa  424  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  63.92 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  58.19 
 
 		 358 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  56.37 
 
 		 357 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  58.17 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  58.81 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  59.04 
 
 		 358 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  57.7 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  62.32 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  56.98 
 
 		 363 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 		 360 aa  408  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  57.3 
 
 		 360 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 		 360 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 353 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 		 360 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 360 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 360 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  61.08 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 360 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  57.46 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  55.4 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  55.68 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  55.68 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  58.29 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  55.03 
 
 		 364 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  53.11 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  56.15 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>